محققان امیدوارند که تحقیق روی سلول‌‌‌ بنیادی‌ بتواند به موارد زیر کمک کند:

۱. درک نحوه بروز بیماری‌ها

با مشاهده سلول‌‌های بنیادی‌ای که در استخوان‌ها، عضله قلب، اعصاب و سایر اندام‌ها و بافت‌ها بالغ می‌شوند، محققان می‌توانند نحوه ایجاد بیماری‌های مختلف را بهتر درک کنند.

۲. تولید سلول‌های سالم برای جایگزینی سلول‌های آسیب‌دیده

سلول‌‌های بنیادی‌‌ به سلول‌های خاصی تبدیل می‌شوند که می‌توانند برای بازسازی و ترمیم بافت‌هایی که تحت تاثیر بیماری قرار گرفته‌اند یا آسیب دیده‌اند، استفاده شوند. از بیماری های قابل درمان با سلول های بنیادی می‌توان به آسیب‌های نخاعی، دیابت نوع یک، بیماری پارکینسون، اسکلروز جانبی آمیوتروفیک، بیماری آلزایمر، بیماری قلبی، سکته مغزی، سوختگی، سرطان و آرتروز اشاره کرد.

علاوه بر این، به نظر می‌رسد که سلول‌‌های‌ بنیادی‌‌ ممکن است پتانسیل رشد برای تبدیل شدن به بافت جدید و استفاده در پزشکی بازساختی (ترمیم یا جایگزینی بافت‌های آسیب‌دیده) یا پیوند را داشته باشند.

۳. بررسی اثربخشی و ایمنی داروهای جدید

قبل از مصرف هر گونه داروی جدید توسط بیماران، محققان می‌توانند از بعضی از Stem cells برای آزمایش ایمنی و کیفیت دارو استفاده کنند. برای اینکه آزمایش داروهای جدید دقیق باشد، سلول‌ها باید به گونه‌ای برنامه‌ریزی شوند که ویژگی‌های سلول‌های مورد هدف دارو را کسب کنند. به عنوان مثال، می‌توان با تولید سلول‌های عصبی تاثیر یک داروی جدید را برای درمان بیماری‌های عصبی بررسی کرد.